（一）使乙肝表面抗原转阴的药物：目前还没有能够肯定让表面抗原转阴的药物。那些自称能够让表面抗原肯定转阴或大多数转阴的药物或疗法大都缺乏科学根据。但必须指出，表面抗原阳性患者每年可有1%～2%的自然阴转率，也就是说，不经任何治疗，这些患者的表面抗原也会自然阴转，特别是表面抗原的滴度很低者。另外，下面所谈到的对e抗原有效的药物，一般对表面抗原也都有一定的疗效。只是疗效较低，一般不超过10%。
（二）使e抗原转阴的药物：比较多，但阴转率大都在40%～50%左右，故疗效也并不令人满意。现介绍如下：
1.潘生丁合用卡介苗：潘生丁25毫克，每日3次，口服，同时皮内注射卡介苗0.1毫升，每月1次。疗程6～8个月。在注射卡介苗前，应做OT试验，“++”（注射皮丘直径
<19毫米）以上者，肺透视阴性者方可注射。一般在前臂三角肌处皮内注射，切忌注于皮下或肌肉，否则会发生寒性脓疡，经久不愈这是最值得注意的。此疗法最便宜，已应用数百例，“七五”攻关即证明其有效。“八五”攻关又对本疗法进行了验证，治疗结束时e抗原转阴率为56.5%（13/23）、HBV-DNA的阴转60.9%（14/23）。1年后两者阴转率分别为70%（14/20）及60%（12/20）。
2.肝炎灵（广豆根）注射液：每日2支，肌注，共3个月，e抗原阴转率37%，且有较好的降低血清转氨酶的作用。但停药太快，可能反跳，故注射3个月后要逐渐停药。本药注射部位疼痛，故应深部注射。也有人主张，注射5日停2日，共6个月。
3.猪苓多糖合用乙肝疫苗：猪苓多糖4毫升（40毫克），肌注，连用20日，停10日，为一疗程，连用3个疗程。同时皮下注射乙肝疫苗30微克/次，每半月一次，共6次。“七五”攻关证明有效，“八五”攻关又进行验证，e抗原阴转率43.6%（34/78），HBV-DNA阴转率44.9%（35/78）。1年后两者阴转率分别为59%（46/78）及57.7%（45/78）。
4.单磷酸阿糖腺苷（Ara-AMP)合用胸腺肽：前者10毫克/公斤，肌注，连用5日，后5毫克/公斤，肌注，再连用23日。后者10毫克/日，肌注，共3个月。结果e抗原阴转率
47.6%(20/42),HBV-DNA阴转率59.5%（25/42），1年后两者阴转率分别为62.1（18/29）及72.4%（21/29）。有人认为单磷酸阿糖腺苷亦可改为每次注射1支（200毫克），每日两次，共用28日。应用本剂量一般除注射局部疼痛（稀释多一点，注射深一点可减轻）外，无其他严重反应，但如加大剂量、延长疗程则可引起严重的神经肌肉疼痛，应注意。
5.a干扰素：国产品及进口品疗效基本一致。每次3×106～5×106单位，每周3次，肌注，3～6个月。“八五”攻关应用干扰素a-26，3×106单位，肌注，3个月。e抗原阴转率46.9%（30/64），HBV-DNA阴转率48.4%(31/64)，1年后两者的阴转率分别为54.4%（31/57）及52.6%（30/57）。本药的副作用较多，最常见的为类似流感的症状（发热、全身不适等）。对血象等也有一定的影响。
6.日达仙（胸腺肽a1）：1.6毫克/次，每周2次，皮下，共6个月。疗效基本与干扰素相似。其优点是无任何副作用。缺点是价格过于昂贵。目前市售价约900元左右。有人发现某些国产胸腺肽中含有1%的胸腺肽a1，如应用160毫升，静滴，似可代替日达仙。故试用160毫克加入10%葡萄液250毫升静滴，每日1次，连用2个月，第3个月改为每周2次，结果e抗原及HBV-DNA的阴转率分别为50%（25/50）及48%（24/50）。但需注意，目前国产胸腺肽生产的厂家极多，产品质量极不统一，因此使用时必须通知其所含胸腺肽a1的含量。
其他：如LAK细胞回输、HBsAg特异性核糖核酸、无环岛苷、苦参碱、华蟾素、拉米夫丁、法昔洛韦及很多中草药物对e抗原和/或HBV-DNA有不同程度的疗效。
如上所述核心抗体无任何临床意义，因此不需要用药物将其阴转。