从感染了人类乳头瘤病毒到出现临床表现，一般为2周到8个月，平均3个月左右。HPV在人体的温暖潮湿的部位最容易增长繁殖，故外生殖器的皮肤粘膜处最易发病。常见的部位，女性依次为阴道口、小阴唇、阴蒂、大阴唇，会阴、子宫颈口、肛门、尿道口；男性依次为包皮系带、冠状沟、龟头、包皮内板、尿道口、阴茎体、肛门口、阴囊等。有些病人可有好几处损害。少数病人可出现生殖器肛门以外的尖锐湿疣，如足趾缝间、口腔舌边缘、舌系带、脐窝、腋下、乳房等处。
    尖锐湿疣开始时是又小又软的疣状淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，表面高低不平，此时一般无特殊不适感。之后，逐渐增大，长成尖锐湿疣，根据形态可分为两大类：一类叫丘疹型，又叫无柄型，是一种扁平的丘疹；另一类为外生型，根据其不同生长的形态，又可分为菜花型、乳头型、鸡冠型和蕈样型。这些疣一般表面湿润，呈白色、淡红色或污灰色。部分病人感到阴部瘙痒，有异物感、阴部灼痛、性交时疼痛或出血。由于自觉或不自觉的搔抓，可使疣体破损，形成糜烂，可出现渗液、出血和继发感染，由于不断搔抓刺激，尤其是女性再加上炎症白带的浸渍，疣体的增长就更为明显。